Mascot Search Results

Pseudomonas syringae  TOF-TOF  Example

Search title    : SampleSetID: 2022, AnalysisID: 4593, MaldiWellID: 58508, SpectrumID: 69836, Path=\LC PS 2003\ps 2003-10-02\c B16 1\1\B16
Database        : syringae6frame new (1836856 sequences; 298367028 residues)
Taxonomy        : Bacteria (Eubacteria) (1836856 sequences)
Timestamp       : 3 Oct 2003 at 17:57:19 GMT
Top Score       : 1030 for 16853.00116675, 4887162..4888607

Probability Based Mowse Score

Score is -10*Log(P), where P is the probability that the observed match is a random event.
Protein scores greater than 75 are significant (p<0.05).

Score Distribution

Protein Summary Report

Switch to Peptide Summary Report

 

Index of Top 5 Hits

    Accession         Mass    Score   Description (genome sequence location)
 1. 16853.00116675    51882    1030   4887162..4888607
 2. 16853.00116675M   52013    1030   4887159..4888607
 3. 16853.00116674    52116    1030   4887156..4888607
 4. 16853.00116674M   52247    1030   4887153..4888607
 5. 16853.00116680    48838     884   4887249..4888607
 

Results List

1. 16853.00116675  Mass: 51882  Score: 1030  

4887162..4888607

 Observed    Mr(expt)   Mr(calc)    Delta   Start     End  Miss  Ions   Peptide

   878.58     877.57     877.56      0.01     266 -   272    1   ----   IILHARR

   935.48     934.47     934.45      0.01     239 -   247    0   ----   ASDAVMVAR    Oxidation (M)

   941.62     940.62     940.58      0.03      50 -    57    1   ----   LIREIAAR

   962.58     961.57     961.56      0.01     474 -   482    0   ----   ILHVGDPLV

   962.58     961.57     961.56      0.01     474 -   482    0     42   ILHVGDPLV

  1057.43    1056.42    1056.42      0.01     197 -   205    0   ----   DAADMEYAR    Oxidation (M)

  1057.43    1056.42    1056.42      0.01     197 -   205    0      5   DAADMEYAR    Oxidation (M)

  1114.62    1113.61    1113.60      0.01     163 -   174    0   ----   GGGLTAPALTEK

  1257.73    1256.72    1256.71      0.01      61 -    72    0   ----   FVALLGDLQGPK

  1257.73    1256.72    1256.71      0.01      61 -    72    0     96   FVALLGDLQGPK

  1296.69    1295.68    1295.67      0.01     334 -   345    1   ----   ICVGAEKHPTGK    Carbamidomethyl (C)

  1360.72    1359.71    1359.69      0.02     397 -   408    0   ----   SSVPIYAFSPHR

  1360.72    1359.71    1359.69      0.02     397 -   408    0     59   SSVPIYAFSPHR

  1381.66    1380.66    1380.64      0.01      34 -    45    0   ----   LNFSHGTPDEHK

  1453.66    1452.65    1452.63      0.02     460 -   473    0   ----   GDSYHTIGGTNGMK    Oxidation (M)

  1457.81    1456.81    1456.79      0.01     447 -   459    0   ----   GLVEQGDWVILTK

  1533.70    1532.69    1532.68      0.02     117 -   130    0   ----   DCGVGDELLLDDGR    Carbamidomethyl (C)

  1598.85    1597.84    1597.83      0.01     224 -   238    0   ----   AEAVANDEVLDALIR

  1598.85    1597.84    1597.83      0.01     224 -   238    0     36   AEAVANDEVLDALIR

  1613.92    1612.91    1612.89      0.02     446 -   459    1   ----   RGLVEQGDWVILTK

  1629.90    1628.89    1628.88      0.02     395 -   408    1   ----   IRSSVPIYAFSPHR

  1629.90    1628.89    1628.88      0.02     395 -   408    1     16   IRSSVPIYAFSPHR

  1698.91    1697.90    1697.88      0.02     248 -   264    0   ----   GDLGVEIGDAELVGVQK

  1698.91    1697.90    1697.88      0.02     248 -   264    0     35   GDLGVEIGDAELVGVQK

  1826.91    1825.90    1825.89      0.01     181 -   196    0   ----   LAAEMDLDYLAVSFPR    Oxidation (M)

  1826.91    1825.90    1825.89      0.01     181 -   196    0     79   LAAEMDLDYLAVSFPR    Oxidation (M)

  1835.98    1834.98    1834.99     -0.01     378 -   394    0   ----   AIIALTESGYTPLIMSR

  1852.00    1850.99    1850.98      0.01     378 -   394    0   ----   AIIALTESGYTPLIMSR    Oxidation (M)

  1852.00    1850.99    1850.98      0.01     378 -   394    0     18   AIIALTESGYTPLIMSR    Oxidation (M)

  1855.00    1853.99    1853.98      0.01     248 -   265    1   ----   GDLGVEIGDAELVGVQKR

  1997.08    1996.07    1996.06      0.01     221 -   238    1   ----   IERAEAVANDEVLDALIR

  1997.08    1996.07    1996.06      0.01     221 -   238    1     10   IERAEAVANDEVLDALIR

  2195.05    2194.04    2194.02      0.02     358 -   377    0   ----   CDESIALAAMYTANHFPGVK    Carbamidomethyl (C)

  2228.05    2227.04    2227.04      0.00     276 -   295    0   ----   AVIVATQMMESMISSPMPTR    3 Oxidation (M)

  2244.04    2243.03    2243.03      0.00     276 -   295    0   ----   AVIVATQMMESMISSPMPTR    4 Oxidation (M)

  2528.26    2527.25    2527.25      0.00     135 -   157    0   ----   VDTQTAHELHCTVLIGGPLSDHK    Carbamidomethyl (C)

  2528.26    2527.25    2527.25      0.00     135 -   157    0     45   VDTQTAHELHCTVLIGGPLSDHK    Carbamidomethyl (C)

  2762.52    2761.51    2761.52     -0.01       7 -    33    0   ----   IVATLGPASNSPEVIEQLILSGLDVAR

  2762.52    2761.51    2761.52     -0.01       7 -    33    0    136   IVATLGPASNSPEVIEQLILSGLDVAR

  2768.45    2767.44    2767.44     -0.00     419 -   445    0   ----   GVYTVPFDPGALPPGQVSQAAVDELLK

  2848.46    2847.45    2847.44      0.00      91 -   116    0   ----   FTFSTAHPLTSGNQQIVGIDYPDLVK

  2848.46    2847.45    2847.44      0.00      91 -   116    0     71   FTFSTAHPLTSGNQQIVGIDYPDLVK

  2924.53    2923.52    2923.54     -0.02     419 -   446    1     53   GVYTVPFDPGALPPGQVSQAAVDELLKR

  2924.53    2923.52    2923.54     -0.02     419 -   446    1     53   GVYTVPFDPGALPPGQVSQAAVDELLKR

  2924.53    2923.52    2923.54     -0.02     419 -   446    1    108   GVYTVPFDPGALPPGQVSQAAVDELLKR

  3903.91    3902.90    3902.82      0.08     296 -   333    0   ----   AEVSDVANAVLDYTDAVMLSAESAAGSYPVEAVQAMAR    2 Oxidation (M)

No match to: 856.23, 856.53, 859.22, 862.62, 870.55, 882.27, 970.58, 995.63, 1358.70, 1382.67, 1411.86, 1418.73, 1424.74, 1425.25, 1462.78, 1463.28, 1473.78, 1489.80, 1505.78, 1647.86, 1765.04, 1809.97, 1825.90, 1841.96, 1842.92, 1867.99, 2210.04, 2241.09, 2779.97, 2788.43, 2992.66, 3842.99, 3907.81, 3919.83

 

2. 16853.00116675M  Mass: 52013  Score: 1030  

4887159..4888607

 Observed    Mr(expt)   Mr(calc)    Delta   Start     End  Miss  Ions   Peptide

   878.58     877.57     877.56      0.01     267 -   273    1   ----   IILHARR

   935.48     934.47     934.45      0.01     240 -   248    0   ----   ASDAVMVAR    Oxidation (M)

   941.62     940.62     940.58      0.03      51 -    58    1   ----   LIREIAAR

   962.58     961.57     961.56      0.01     475 -   483    0   ----   ILHVGDPLV

   962.58     961.57     961.56      0.01     475 -   483    0     42   ILHVGDPLV

  1057.43    1056.42    1056.42      0.01     198 -   206    0   ----   DAADMEYAR    Oxidation (M)

  1057.43    1056.42    1056.42      0.01     198 -   206    0      5   DAADMEYAR    Oxidation (M)

  1114.62    1113.61    1113.60      0.01     164 -   175    0   ----   GGGLTAPALTEK

  1257.73    1256.72    1256.71      0.01      62 -    73    0   ----   FVALLGDLQGPK

  1257.73    1256.72    1256.71      0.01      62 -    73    0     96   FVALLGDLQGPK

  1296.69    1295.68    1295.67      0.01     335 -   346    1   ----   ICVGAEKHPTGK    Carbamidomethyl (C)

  1360.72    1359.71    1359.69      0.02     398 -   409    0   ----   SSVPIYAFSPHR

  1360.72    1359.71    1359.69      0.02     398 -   409    0     59   SSVPIYAFSPHR

  1381.66    1380.66    1380.64      0.01      35 -    46    0   ----   LNFSHGTPDEHK

  1453.66    1452.65    1452.63      0.02     461 -   474    0   ----   GDSYHTIGGTNGMK    Oxidation (M)

  1457.81    1456.81    1456.79      0.01     448 -   460    0   ----   GLVEQGDWVILTK

  1533.70    1532.69    1532.68      0.02     118 -   131    0   ----   DCGVGDELLLDDGR    Carbamidomethyl (C)

  1598.85    1597.84    1597.83      0.01     225 -   239    0   ----   AEAVANDEVLDALIR

  1598.85    1597.84    1597.83      0.01     225 -   239    0     36   AEAVANDEVLDALIR

  1613.92    1612.91    1612.89      0.02     447 -   460    1   ----   RGLVEQGDWVILTK

  1629.90    1628.89    1628.88      0.02     396 -   409    1   ----   IRSSVPIYAFSPHR

  1629.90    1628.89    1628.88      0.02     396 -   409    1     16   IRSSVPIYAFSPHR

  1698.91    1697.90    1697.88      0.02     249 -   265    0   ----   GDLGVEIGDAELVGVQK

  1698.91    1697.90    1697.88      0.02     249 -   265    0     35   GDLGVEIGDAELVGVQK

  1826.91    1825.90    1825.89      0.01     182 -   197    0   ----   LAAEMDLDYLAVSFPR    Oxidation (M)

  1826.91    1825.90    1825.89      0.01     182 -   197    0     79   LAAEMDLDYLAVSFPR    Oxidation (M)

  1835.98    1834.98    1834.99     -0.01     379 -   395    0   ----   AIIALTESGYTPLIMSR

  1852.00    1850.99    1850.98      0.01     379 -   395    0   ----   AIIALTESGYTPLIMSR    Oxidation (M)

  1852.00    1850.99    1850.98      0.01     379 -   395    0     18   AIIALTESGYTPLIMSR    Oxidation (M)

  1855.00    1853.99    1853.98      0.01     249 -   266    1   ----   GDLGVEIGDAELVGVQKR

  1997.08    1996.07    1996.06      0.01     222 -   239    1   ----   IERAEAVANDEVLDALIR

  1997.08    1996.07    1996.06      0.01     222 -   239    1     10   IERAEAVANDEVLDALIR

  2195.05    2194.04    2194.02      0.02     359 -   378    0   ----   CDESIALAAMYTANHFPGVK    Carbamidomethyl (C)

  2228.05    2227.04    2227.04      0.00     277 -   296    0   ----   AVIVATQMMESMISSPMPTR    3 Oxidation (M)

  2244.04    2243.03    2243.03      0.00     277 -   296    0   ----   AVIVATQMMESMISSPMPTR    4 Oxidation (M)

  2528.26    2527.25    2527.25      0.00     136 -   158    0   ----   VDTQTAHELHCTVLIGGPLSDHK    Carbamidomethyl (C)

  2528.26    2527.25    2527.25      0.00     136 -   158    0     45   VDTQTAHELHCTVLIGGPLSDHK    Carbamidomethyl (C)

  2762.52    2761.51    2761.52     -0.01       8 -    34    0   ----   IVATLGPASNSPEVIEQLILSGLDVAR

  2762.52    2761.51    2761.52     -0.01       8 -    34    0    136   IVATLGPASNSPEVIEQLILSGLDVAR

  2768.45    2767.44    2767.44     -0.00     420 -   446    0   ----   GVYTVPFDPGALPPGQVSQAAVDELLK

  2848.46    2847.45    2847.44      0.00      92 -   117    0   ----   FTFSTAHPLTSGNQQIVGIDYPDLVK

  2848.46    2847.45    2847.44      0.00      92 -   117    0     71   FTFSTAHPLTSGNQQIVGIDYPDLVK

  2924.53    2923.52    2923.54     -0.02     420 -   447    1     53   GVYTVPFDPGALPPGQVSQAAVDELLKR

  2924.53    2923.52    2923.54     -0.02     420 -   447    1     53   GVYTVPFDPGALPPGQVSQAAVDELLKR

  2924.53    2923.52    2923.54     -0.02     420 -   447    1    108   GVYTVPFDPGALPPGQVSQAAVDELLKR

  3903.91    3902.90    3902.82      0.08     297 -   334    0   ----   AEVSDVANAVLDYTDAVMLSAESAAGSYPVEAVQAMAR    2 Oxidation (M)

No match to: 856.23, 856.53, 859.22, 862.62, 870.55, 882.27, 970.58, 995.63, 1358.70, 1382.67, 1411.86, 1418.73, 1424.74, 1425.25, 1462.78, 1463.28, 1473.78, 1489.80, 1505.78, 1647.86, 1765.04, 1809.97, 1825.90, 1841.96, 1842.92, 1867.99, 2210.04, 2241.09, 2779.97, 2788.43, 2992.66, 3842.99, 3907.81, 3919.83

 

3. 16853.00116674  Mass: 52116  Score: 1030  

4887156..4888607

 Observed    Mr(expt)   Mr(calc)    Delta   Start     End  Miss  Ions   Peptide

   878.58     877.57     877.56      0.01     268 -   274    1   ----   IILHARR

   935.48     934.47     934.45      0.01     241 -   249    0   ----   ASDAVMVAR    Oxidation (M)

   941.62     940.62     940.58      0.03      52 -    59    1   ----   LIREIAAR

   962.58     961.57     961.56      0.01     476 -   484    0   ----   ILHVGDPLV

   962.58     961.57     961.56      0.01     476 -   484    0     42   ILHVGDPLV

  1057.43    1056.42    1056.42      0.01     199 -   207    0   ----   DAADMEYAR    Oxidation (M)

  1057.43    1056.42    1056.42      0.01     199 -   207    0      5   DAADMEYAR    Oxidation (M)

  1114.62    1113.61    1113.60      0.01     165 -   176    0   ----   GGGLTAPALTEK

  1257.73    1256.72    1256.71      0.01      63 -    74    0   ----   FVALLGDLQGPK

  1257.73    1256.72    1256.71      0.01      63 -    74    0     96   FVALLGDLQGPK

  1296.69    1295.68    1295.67      0.01     336 -   347    1   ----   ICVGAEKHPTGK    Carbamidomethyl (C)

  1360.72    1359.71    1359.69      0.02     399 -   410    0   ----   SSVPIYAFSPHR

  1360.72    1359.71    1359.69      0.02     399 -   410    0     59   SSVPIYAFSPHR

  1381.66    1380.66    1380.64      0.01      36 -    47    0   ----   LNFSHGTPDEHK

  1453.66    1452.65    1452.63      0.02     462 -   475    0   ----   GDSYHTIGGTNGMK    Oxidation (M)

  1457.81    1456.81    1456.79      0.01     449 -   461    0   ----   GLVEQGDWVILTK

  1533.70    1532.69    1532.68      0.02     119 -   132    0   ----   DCGVGDELLLDDGR    Carbamidomethyl (C)

  1598.85    1597.84    1597.83      0.01     226 -   240    0   ----   AEAVANDEVLDALIR

  1598.85    1597.84    1597.83      0.01     226 -   240    0     36   AEAVANDEVLDALIR

  1613.92    1612.91    1612.89      0.02     448 -   461    1   ----   RGLVEQGDWVILTK

  1629.90    1628.89    1628.88      0.02     397 -   410    1   ----   IRSSVPIYAFSPHR

  1629.90    1628.89    1628.88      0.02     397 -   410    1     16   IRSSVPIYAFSPHR

  1698.91    1697.90    1697.88      0.02     250 -   266    0   ----   GDLGVEIGDAELVGVQK

  1698.91    1697.90    1697.88      0.02     250 -   266    0     35   GDLGVEIGDAELVGVQK

  1826.91    1825.90    1825.89      0.01     183 -   198    0   ----   LAAEMDLDYLAVSFPR    Oxidation (M)

  1826.91    1825.90    1825.89      0.01     183 -   198    0     79   LAAEMDLDYLAVSFPR    Oxidation (M)

  1835.98    1834.98    1834.99     -0.01     380 -   396    0   ----   AIIALTESGYTPLIMSR

  1852.00    1850.99    1850.98      0.01     380 -   396    0   ----   AIIALTESGYTPLIMSR    Oxidation (M)

  1852.00    1850.99    1850.98      0.01     380 -   396    0     18   AIIALTESGYTPLIMSR    Oxidation (M)

  1855.00    1853.99    1853.98      0.01     250 -   267    1   ----   GDLGVEIGDAELVGVQKR

  1997.08    1996.07    1996.06      0.01     223 -   240    1   ----   IERAEAVANDEVLDALIR

  1997.08    1996.07    1996.06      0.01     223 -   240    1     10   IERAEAVANDEVLDALIR

  2195.05    2194.04    2194.02      0.02     360 -   379    0   ----   CDESIALAAMYTANHFPGVK    Carbamidomethyl (C)

  2228.05    2227.04    2227.04      0.00     278 -   297    0   ----   AVIVATQMMESMISSPMPTR    3 Oxidation (M)

  2244.04    2243.03    2243.03      0.00     278 -   297    0   ----   AVIVATQMMESMISSPMPTR    4 Oxidation (M)

  2528.26    2527.25    2527.25      0.00     137 -   159    0   ----   VDTQTAHELHCTVLIGGPLSDHK    Carbamidomethyl (C)

  2528.26    2527.25    2527.25      0.00     137 -   159    0     45   VDTQTAHELHCTVLIGGPLSDHK    Carbamidomethyl (C)

  2762.52    2761.51    2761.52     -0.01       9 -    35    0   ----   IVATLGPASNSPEVIEQLILSGLDVAR

  2762.52    2761.51    2761.52     -0.01       9 -    35    0    136   IVATLGPASNSPEVIEQLILSGLDVAR

  2768.45    2767.44    2767.44     -0.00     421 -   447    0   ----   GVYTVPFDPGALPPGQVSQAAVDELLK

  2848.46    2847.45    2847.44      0.00      93 -   118    0   ----   FTFSTAHPLTSGNQQIVGIDYPDLVK

  2848.46    2847.45    2847.44      0.00      93 -   118    0     71   FTFSTAHPLTSGNQQIVGIDYPDLVK

  2924.53    2923.52    2923.54     -0.02     421 -   448    1     53   GVYTVPFDPGALPPGQVSQAAVDELLKR

  2924.53    2923.52    2923.54     -0.02     421 -   448    1     53   GVYTVPFDPGALPPGQVSQAAVDELLKR    Oxidation (M)

  2924.53    2923.52    2923.54     -0.02     421 -   448    1    108   GVYTVPFDPGALPPGQVSQAAVDELLKR

  3903.91    3902.90    3902.82      0.08     298 -   335    0   ----   AEVSDVANAVLDYTDAVMLSAESAAGSYPVEAVQAMAR    2 Oxidation (M)

No match to: 856.23, 856.53, 859.22, 862.62, 870.55, 882.27, 970.58, 995.63, 1358.70, 1382.67, 1411.86, 1418.73, 1424.74, 1425.25, 1462.78, 1463.28, 1473.78, 1489.80, 1505.78, 1647.86, 1765.04, 1809.97, 1825.90, 1841.96, 1842.92, 1867.99, 2210.04, 2241.09, 2779.97, 2788.43, 2992.66, 3842.99, 3907.81, 3919.83

 

4. 16853.00116674M  Mass: 52247  Score: 1030  

4887153..4888607

 Observed    Mr(expt)   Mr(calc)    Delta   Start     End  Miss  Ions   Peptide

   878.58     877.57     877.56      0.01     269 -   275    1   ----   IILHARR

   935.48     934.47     934.45      0.01     242 -   250    0   ----   ASDAVMVAR    Oxidation (M)