Mascot Search Results

Pseudomonas syringae  TOF-TOF  Example

Protein View

Match to: 16853.00116675; Score: 1030
4887162..4888607
 
Nominal mass (Mr): 51882; Calculated pI value: 6.35
NCBI BLAST search of 16853.00116675 against nr
 
 
Variable modifications: Carbamidomethyl (C),Oxidation (M),Propionamide (C)
Cleavage by Trypsin: cuts C-term side of KR unless next residue is P
Sequence Coverage: 82%
 
Matched peptides shown in Bold Red
 
     1 TVRRTKIVAT LGPASNSPEV IEQLILSGLD VARLNFSHGT PDEHKARAKL 
    51 IREIAARHGR FVALLGDLQG PKIRIAKFTD KRIELKVGDK FTFSTAHPLT 
   101 SGNQQIVGID YPDLVKDCGV GDELLLDDGR VVMRVDTQTA HELHCTVLIG 
   151 GPLSDHKGIN RRGGGLTAPA LTEKDKQDIK LAAEMDLDYL AVSFPRDAAD 
   201 MEYARQLRDE SGGTAWLVAK IERAEAVAND EVLDALIRAS DAVMVARGDL 
   251 GVEIGDAELV GVQKRIILHA RRHNKAVIVA TQMMESMISS PMPTRAEVSD 
   301 VANAVLDYTD AVMLSAESAA GSYPVEAVQA MARICVGAEK HPTGKTSSHR 
   351 IGHSFTRCDE SIALAAMYTA NHFPGVKAII ALTESGYTPL IMSRIRSSVP 
   401 IYAFSPHRGT QARAAMFRGV YTVPFDPGAL PPGQVSQAAV DELLKRGLVE 
   451 QGDWVILTKG DSYHTIGGTN GMKILHVGDP LV

 

 Start - End   Observed  Mr(expt) Mr(calc)   Delta   Miss Sequence
     7 - 33     2762.52  2761.51  2761.52    -0.01     0  IVATLGPASNSPEVIEQLILSGLDVAR (Ions score 136)
     7 - 33     2762.52  2761.51  2761.52    -0.01     0  IVATLGPASNSPEVIEQLILSGLDVAR (No match)
    34 - 45     1381.66  1380.66  1380.64     0.01     0  LNFSHGTPDEHK (No match)
    50 - 57      941.62   940.62   940.58     0.03     1  LIREIAAR (No match)
    61 - 72     1257.73  1256.72  1256.71     0.01     0  FVALLGDLQGPK (Ions score 96)
    61 - 72     1257.73  1256.72  1256.71     0.01     0  FVALLGDLQGPK (No match)
    91 - 116    2848.46  2847.45  2847.44     0.00     0  FTFSTAHPLTSGNQQIVGIDYPDLVK (Ions score 71)
    91 - 116    2848.46  2847.45  2847.44     0.00     0  FTFSTAHPLTSGNQQIVGIDYPDLVK (No match)
   117 - 130    1533.70  1532.69  1532.68     0.02     0  DCGVGDELLLDDGR  Carbamidomethyl (C) (No match)
   135 - 157    2528.26  2527.25  2527.25     0.00     0  VDTQTAHELHCTVLIGGPLSDHK  Carbamidomethyl (C) (Ions score 45)
   135 - 157    2528.26  2527.25  2527.25     0.00     0  VDTQTAHELHCTVLIGGPLSDHK  Carbamidomethyl (C) (No match)
   163 - 174    1114.62  1113.61  1113.60     0.01     0  GGGLTAPALTEK (No match)
   181 - 196    1826.91  1825.90  1825.89     0.01     0  LAAEMDLDYLAVSFPR  Oxidation (M) (Ions score 79)
   181 - 196    1826.91  1825.90  1825.89     0.01     0  LAAEMDLDYLAVSFPR  Oxidation (M) (No match)
   197 - 205    1057.43  1056.42  1056.42     0.01     0  DAADMEYAR  Oxidation (M) (No match)
   197 - 205    1057.43  1056.42  1056.42     0.01     0  DAADMEYAR  Oxidation (M) (Ions score 5)
   221 - 238    1997.08  1996.07  1996.06     0.01     1  IERAEAVANDEVLDALIR (No match)
   221 - 238    1997.08  1996.07  1996.06     0.01     1  IERAEAVANDEVLDALIR (Ions score 10)
   224 - 238    1598.85  1597.84  1597.83     0.01     0  AEAVANDEVLDALIR (Ions score 36)
   224 - 238    1598.85  1597.84  1597.83     0.01     0  AEAVANDEVLDALIR (No match)
   239 - 247     935.48   934.47   934.45     0.01     0  ASDAVMVAR  Oxidation (M) (No match)
   248 - 264    1698.91  1697.90  1697.88     0.02     0  GDLGVEIGDAELVGVQK (Ions score 35)
   248 - 264    1698.91  1697.90  1697.88     0.02     0  GDLGVEIGDAELVGVQK (No match)
   248 - 265    1855.00  1853.99  1853.98     0.01     1  GDLGVEIGDAELVGVQKR (No match)
   266 - 272     878.58   877.57   877.56     0.01     1  IILHARR (No match)
   276 - 295    2228.05  2227.04  2227.04     0.00     0  AVIVATQMMESMISSPMPTR  3 Oxidation (M) (No match)
   276 - 295    2244.04  2243.03  2243.03     0.00     0  AVIVATQMMESMISSPMPTR  4 Oxidation (M) (No match)
   296 - 333    3903.91  3902.90  3902.82     0.08     0  AEVSDVANAVLDYTDAVMLSAESAAGSYPVEAVQAMAR  2 Oxidation (M) (No match)
   334 - 345    1296.69  1295.68  1295.67     0.01     1  ICVGAEKHPTGK  Carbamidomethyl (C) (No match)
   358 - 377    2195.05  2194.04  2194.02     0.02     0  CDESIALAAMYTANHFPGVK  Carbamidomethyl (C) (No match)
   378 - 394    1835.98  1834.98  1834.99    -0.01     0  AIIALTESGYTPLIMSR (No match)
   378 - 394    1852.00  1850.99  1850.98     0.01     0  AIIALTESGYTPLIMSR  Oxidation (M) (No match)
   378 - 394    1852.00  1850.99  1850.98     0.01     0  AIIALTESGYTPLIMSR  Oxidation (M) (Ions score 18)
   395 - 408    1629.90  1628.89  1628.88     0.02     1  IRSSVPIYAFSPHR (No match)
   395 - 408    1629.90  1628.89  1628.88     0.02     1  IRSSVPIYAFSPHR (Ions score 16)
   397 - 408    1360.72  1359.71  1359.69     0.02     0  SSVPIYAFSPHR (Ions score 59)
   397 - 408    1360.72  1359.71  1359.69     0.02     0  SSVPIYAFSPHR (No match)
   419 - 445    2768.45  2767.44  2767.44    -0.00     0  GVYTVPFDPGALPPGQVSQAAVDELLK (No match)
   419 - 446    2924.53  2923.52  2923.54    -0.02     1  GVYTVPFDPGALPPGQVSQAAVDELLKR (Ions score 53)
   419 - 446    2924.53  2923.52  2923.54    -0.02     1  GVYTVPFDPGALPPGQVSQAAVDELLKR (Ions score 53)
   419 - 446    2924.53  2923.52  2923.54    -0.02     1  GVYTVPFDPGALPPGQVSQAAVDELLKR (Ions score 108)
   446 - 459    1613.92  1612.91  1612.89     0.02     1  RGLVEQGDWVILTK (No match)
   447 - 459    1457.81  1456.81  1456.79     0.01     0  GLVEQGDWVILTK (No match)
   460 - 473    1453.66  1452.65  1452.63     0.02     0  GDSYHTIGGTNGMK  Oxidation (M) (No match)
   474 - 482     962.58   961.57   961.56     0.01     0  ILHVGDPLV (No match)
   474 - 482     962.58   961.57   961.56     0.01     0  ILHVGDPLV (Ions score 42)

Error Distribution

 
 





 
 
 
 

Mascot:  http://www.matrixscience.com/index.html